Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Пакети >> ecne (12.0LTS) >> python >> python3-pairtools-examples
[  aramo  ] [  ecne  ] [  xolotl  ]
[ Източник: pairtools  ]

Пакет: python3-pairtools-examples (1.0.3-1build1)

Process sequencing data from a Hi-C experiment (examples)

Simple and fast command-line framework to process sequencing data from a Hi-C experiment.

Process pair-end sequence alignments and perform the following operations:

  - Detect ligation junctions (a.k.a. Hi-C pairs) in aligned paired-end
    sequences of Hi-C DNA molecules
  - Sort .pairs files for downstream analyses
  - Detect, tag and remove PCR/optical duplicates
  - Generate extensive statistics of Hi-C datasets
  - Select Hi-C pairs given flexibly defined criteria
  - Restore .sam alignments from Hi-C pairs

This package contains some examples

Други пакети, свързани с python3-pairtools-examples

  • зависимости
  • препоръчани
  • предложени

Изтегляне на python3-pairtools-examples

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура Големина на пакета Големина след инсталиране Файлове
amd64 785,1 кБ841 кБ [списък на файловете]
arm64 785,1 кБ841 кБ [списък на файловете]
armhf 785,1 кБ841 кБ [списък на файловете]
ppc64el 785,1 кБ841 кБ [списък на файловете]
riscv64 785,1 кБ841 кБ [списък на файловете]