Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Пакети >> ecne (12.0LTS) >> python >> python3-pyabpoa
[  ecne  ] [  xolotl  ]
[ Източник: abpoa  ]

Пакет: python3-pyabpoa (1.5.1-1build1)

Връзки за python3-pyabpoa

python3-pyabpoa

Ресурси за Trisquel:

Изтегляне на пакет-източник abpoa.

Отговорник:

Original Maintainers:

Външни препратки:

Подобни пакети:

adaptive banded Partial Order Alignment - python3 module

abPOA is an extended version of Partial Order Alignment (POA) that performs adaptive banded dynamic programming (DP) with an SIMD implementation. abPOA can perform multiple sequence alignment (MSA) on a set of input sequences and generate a consensus sequence by applying the heaviest bundling algorithm to the final alignment graph.

abPOA can generate high-quality consensus sequences from error-prone long reads and offer significant speed improvement over existing tools.

abPOA supports three alignment modes (global, local, extension) and flexible scoring schemes that allow linear, affine and convex gap penalties. It right now supports SSE2/SSE4.1/AVX2 vectorization.

This package provides the python3 module of abPOA.

Други пакети, свързани с python3-pyabpoa

  • зависимости
  • препоръчани
  • предложени
  • dep: libc6 (>= 2.33)
    GNU C Library: Shared libraries
    също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb
  • dep: python3 (<< 3.13)
    interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
    dep: python3 (>= 3.12~)
  • dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
    compression library - runtime

Изтегляне на python3-pyabpoa

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура Големина на пакета Големина след инсталиране Файлове
amd64 166,4 кБ420 кБ [списък на файловете]
arm64 154,5 кБ412 кБ [списък на файловете]
ppc64el 181,2 кБ476 кБ [списък на файловете]
riscv64 193,8 кБ384 кБ [списък на файловете]