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Paket: python3-cyvcf2 (0.30.14-1build1)

Links für python3-cyvcf2

python3-cyvcf2

Trisquel-Ressourcen:

Quellcode-Paket cyvcf2 herunterladen:

Betreuer:

Original Maintainers:

  • Debian Med Packaging Team (E-Mail-Archiv)
  • Steffen Moeller
  • Liubov Chuprikova
  • Nilesh Patra

Externe Ressourcen:

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This package installs the library for Python 3.

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    dep: python3 (<< 3.11)
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  • dep: python3-click
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  • dep: python3-coloredlogs
    colored terminal output for Python 3's logging module
  • dep: python3-numpy (>= 1:1.20.0)
    Fast array facility to the Python 3 language
  • dep: python3-numpy-abi9
    virtuelles Paket, bereitgestellt durch python3-numpy

python3-cyvcf2 herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur Paketgröße Größe (installiert) Dateien
amd64 817,0 kB4733 kB [Liste der Dateien]
arm64 806,8 kB4671 kB [Liste der Dateien]
armhf 794,9 kB4455 kB [Liste der Dateien]
ppc64el 874,8 kB5036 kB [Liste der Dateien]