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[ Quellcode: r-cran-sctransform  ]

Paket: r-cran-sctransform (0.3.3-1)

Variance Stabilizing Transformations for Single Cell UMI Data

A normalization method for single-cell UMI count data using a variance stabilizing transformation. The transformation is based on a negative binomial regression model with regularized parameters. As part of the same regression framework, this package also provides functions for batch correction, and data correction. See Hafemeister and Satija 2019 <doi:10.1101/576827> for more details.

Andere Pakete mit Bezug zu r-cran-sctransform

  • hängt ab von
  • empfiehlt
  • schlägt vor
  • sug: r-cran-irlba
    GNU R fast truncated SVD, PCA and symmetric eigendecomposition
  • sug: r-cran-knitr
    GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

r-cran-sctransform herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur Paketgröße Größe (installiert) Dateien
amd64 487,4 kB730 kB [Liste der Dateien]
arm64 478,6 kB702 kB [Liste der Dateien]
armhf 478,0 kB649 kB [Liste der Dateien]
ppc64el 492,3 kB818 kB [Liste der Dateien]