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nabia  ] [  aramo  ]
[ Quellcode: libbio-alignio-stockholm-perl  ]

Paket: libbio-alignio-stockholm-perl (1.7.3-1)

stockholm sequence input/output stream

Indexes Stockholm format alignments such as those from Pfam and Rfam. Returns raw stream data using the ID or a Bio::SimpleAlign object (via Bio::AlignIO).

Bio::AlignIO::stockholm also allows for ID parsing using a callback:

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  • hängt ab von
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  • dep: libbio-perl-perl
    BioPerl core perl modules
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    Larry Wall's Practical Extraction and Report Language

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