Paquet : brig (0.95+dfsg-3)
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Original Maintainers:
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- Andreas Tille
Ressources externes :
- Page d'accueil [sourceforge.net]
Paquets similaires :
BLAST Ring Image Generator
BRIG can display circular comparisons between a large number of genomes, with a focus on handling genome assembly data.
* Images show similarity between a central reference sequence and other sequences as concentric rings. * BRIG will perform all BLAST comparisons and file parsing automatically via a simple GUI. * Contig boundaries and read coverage can be displayed for draft genomes; customized graphs and annotations can be displayed. * Using a user-defined set of genes as input, BRIG can display gene presence, absence, truncation or sequence variation in a set of complete genomes, draft genomes or even raw, unassembled sequence data. * BRIG also accepts SAM-formatted read-mapping files enabling genomic regions present in unassembled sequence data from multiple samples to be compared simultaneously
Autres paquets associés à brig
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Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
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ppc64el | 111,9 ko | 412 ko | [liste des fichiers] |