Paquet : python3-pairtools (1.0.3-1build1)

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Télécharger le paquet source pairtools :

Responsable :

Debian Med Packaging Team (Archive du courrier électronique)

Original Maintainers:

Debian Med Packaging Team (Archive du courrier électronique)
Antoni Villalonga

Ressources externes :

Page d'accueil [github.com]

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    sequences of Hi-C DNA molecules
  - Sort .pairs files for downstream analyses
  - Detect, tag and remove PCR/optical duplicates
  - Generate extensive statistics of Hi-C datasets
  - Select Hi-C pairs given flexibly defined criteria
  - Restore .sam alignments from Hi-C pairs

Autres paquets associés à python3-pairtools

dépendances

recommandations

suggestions

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

GNU C Library: Shared libraries
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

dep: libc6 (>= 2.4) [armhf]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [riscv64]

GCC support library

dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [non armhf, riscv64]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]
dep: libstdc++6 (>= 11)

GNU Standard C++ Library v3
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

dep: python3 (<< 3.13)

dep: python3 (>= 3.12~)
dep: python3-bioframe

library to enable flexible, scalable operations on genomic interval dataframes
dep: python3-click

Wrapper around optparse for command line utilities - Python 3.x
dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0)

Fast array facility to the Python language (Python 3)
dep: python3-numpy-abi9

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dep: python3-pandas

data structures for "relational" or "labeled" data
dep: python3-pysam (>= 0.20.0+ds-3~)

interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)
dep: python3-scipy

scientific tools for Python 3
dep: python3-yaml

YAML parser and emitter for Python3

sug: python3-pairtools-examples (>= 1.0.2)

Process sequencing data from a Hi-C experiment (examples)

Télécharger python3-pairtools

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	196,0 ko	775 ko	[liste des fichiers]
arm64	188,0 ko	889 ko	[liste des fichiers]
armhf	181,4 ko	613 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	220,8 ko	953 ko	[liste des fichiers]
riscv64	195,3 ko	693 ko	[liste des fichiers]

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