Paquet : python3-pyabpoa (1.5.1-1build1)
Liens pour python3-pyabpoa
Ressources Trisquel :
Télécharger le paquet source abpoa :
Responsable :
Original Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (Archive du courrier électronique)
- Étienne Mollier
Ressources externes :
- Page d'accueil [github.com]
Paquets similaires :
adaptive banded Partial Order Alignment - python3 module
abPOA is an extended version of Partial Order Alignment (POA) that performs adaptive banded dynamic programming (DP) with an SIMD implementation. abPOA can perform multiple sequence alignment (MSA) on a set of input sequences and generate a consensus sequence by applying the heaviest bundling algorithm to the final alignment graph.
abPOA can generate high-quality consensus sequences from error-prone long reads and offer significant speed improvement over existing tools.
abPOA supports three alignment modes (global, local, extension) and flexible scoring schemes that allow linear, affine and convex gap penalties. It right now supports SSE2/SSE4.1/AVX2 vectorization.
This package provides the python3 module of abPOA.
Autres paquets associés à python3-pyabpoa
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- dep: libc6 (>= 2.33)
- GNU C Library: Shared libraries
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
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- dep: python3 (<< 3.13)
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
- dep: python3 (>= 3.12~)
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- compression library - runtime
Télécharger python3-pyabpoa
| Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
|---|---|---|---|
| amd64 | 166,4 ko | 420 ko | [liste des fichiers] |
| arm64 | 154,5 ko | 412 ko | [liste des fichiers] |
| ppc64el | 181,2 ko | 476 ko | [liste des fichiers] |
| riscv64 | 193,8 ko | 384 ko | [liste des fichiers] |