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[ Paquet source : daligner  ]

Paquet : daligner (1.0+20180108-1)

local alignment discovery between long nucleotide sequencing reads

These tools permit one to find all significant local alignments between reads encoded in a Dazzler database. The assumption is that the reads are from a Pacific Biosciences RS II long read sequencer. That is, the reads are long and noisy, up to 15% on average.

Autres paquets associés à daligner

  • dépendances
  • recommandations
  • suggestions
  • dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
    GNU C Library: Shared libraries
    un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.7) [i386]
  • sug: dascrubber
    alignment-based scrubbing pipeline for DNA sequencing reads
  • sug: dazzdb
    manage nucleotide sequencing read data

Télécharger daligner

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture Taille du paquet Espace occupé une fois installé Fichiers
amd64 171,8 ko1139 ko [liste des fichiers]
i386 167,7 ko1241 ko [liste des fichiers]