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[ Paquet source : qcumber  ]

Paquet : qcumber (1.0.14+dfsg-1)

quality control of genomic sequences

QCPipeline is a tool for quality control. The workflow is as follows:

 1. Quality control with FastQC
 2. Trim Reads with Trimmomatic
 3. Quality control of trimmed reads with FastQC
 4. Map reads against reference using bowtie2
 5. Classify reads with Kraken

Autres paquets associés à qcumber

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all 35,2 ko168 ko [liste des fichiers]