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[ Paquet source : cyvcf2 ]
Paquet : python3-cyvcf2 (0.11.6-1)
Liens pour python3-cyvcf2
Ressources Trisquel :
Télécharger le paquet source cyvcf2 :
Responsable :
Original Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (Archive du courrier électronique)
- Steffen Moeller
- Liubov Chuprikova
Ressources externes :
- Page d'accueil [github.com]
Paquets similaires :
VCF parser based on htslib (Python 3)
This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.
cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.
This package installs the library for Python 3.
Autres paquets associés à python3-cyvcf2
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- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- GNU C Library: Shared libraries
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.7) [armhf]
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- dep: libhts3 (>= 1.10)
- C library for high-throughput sequencing data formats
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
- dep: python3 (<< 3.9)
- dep: python3 (>= 3.8~)
-
- dep: python3-click
- Wrapper around optparse for command line utilities - Python 3.x
-
- dep: python3-coloredlogs
- colored terminal output for Python 3's logging module
-
- dep: python3-numpy (>= 1:1.16.0~rc1)
- Fast array facility to the Python 3 language
-
- dep: python3-numpy-abi9
- paquet virtuel fourni par python3-numpy
Télécharger python3-cyvcf2
| Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
|---|---|---|---|
| amd64 | 829,5 ko | 4700 ko | [liste des fichiers] |
| armhf | 797,1 ko | 4404 ko | [liste des fichiers] |