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Paquet source : sga (0.10.15-3)

Liens pour sga

Ressources Trisquel :

Responsable :

Original Maintainers:

Ressources externes :

Les paquets binaires suivants sont compilés à partir de ce paquet source :
sga
de novo genome assembler that uses string graphs

Autres paquets associés à sga

  • build-depends
  • build-depends-indep
  • adep: debhelper (>= 10)
    helper programs for debian/rules
  • adep: dh-autoreconf
    debhelper add-on to call autoreconf and clean up after the build
  • adep: libsparsehash-dev
    Google's extremely memory-efficient C++ hash_map implementation
  • adep: zlib1g-dev
    compression library - development
    ou libz-dev
    paquet virtuel fourni par zlib1g-dev
  • adep: libbamtools-dev
    C++ API for manipulating BAM (genome alignment) files
  • adep: gawk
    GNU awk, a pattern scanning and processing language
  • adep: help2man
    Automatic manpage generator
  • adep: samtools
    processing sequence alignments in SAM and BAM formats
  • adep: python
    interactive high-level object-oriented language (default version)
  • adep: python-ruffus
    Python computation pipeline library widely used in bioinformatics
  • adep: python-pysam
    interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 2)

Download sga

FichierTaille (en ko)Somme MD5
sga_0.10.15-3.dsc 2,0 ko e76b2876413107d05d680eeb5dd8510c
sga_0.10.15.orig.tar.gz 6 416,0 ko 990aed1593f8072650c6366e5cf32519
sga_0.10.15-3.debian.tar.xz 205,9 ko 3a8e00dc3d5a4a2c87722ed292658eaa
Dépôt Debian des paquets source (VCS: Git)
https://anonscm.debian.org/git/debian-med/sga.git
Dépôt Debian des paquets source (interface web)
https://anonscm.debian.org/cgit/debian-med/sga.git