Skip to content
Sections
>> Trisquel >> パッケージ >> aramo >> science >> sambamba
etiona  ] [  aramo  ]
[ ソース: sambamba  ]

パッケージ: sambamba (0.8.2+dfsg-2)

tools for working with SAM/BAM data

Sambamba positions itself as a performant alternative to samtools and provides tools for

 * Powerful filtering with sambamba view --filter
 * Picard-like SAM header merging in the merge tool
 * Optional for operations on whole BAMs
 * Fast copying of a region to a new file with the slice tool
 * Duplicate marking/removal, using the Picard criteria

その他の sambamba 関連パッケージ

  • 依存
  • 推奨
  • 提案
  • dep: libc6 (>= 2.34)
    GNU C Library: Shared libraries
    以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
  • dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
    GCC support library
  • dep: liblz4-1 (>= 0.0~r127)
    Fast LZ compression algorithm library - runtime
  • dep: libphobos2-ldc-shared98 (>= 1:1.28.0)
    LLVM D Compiler - Standard and runtime libraries
  • dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
    compression library - runtime

sambamba のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ パッケージサイズ インストールサイズ ファイル
arm64 619.1 kB2633 kB [ファイル一覧]