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パッケージ: snap-aligner (1.0.0+dfsg-3)

snap-aligner に関するリンク

snap-aligner

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類似のパッケージ:

Scalable Nucleotide Alignment Program

SNAP is a new sequence aligner that is 3-20x faster and just as accurate as existing tools like BWA-mem, Bowtie2 and Novoalign. It runs on commodity x86 processors, and supports a rich error model that lets it cheaply match reads with more differences from the reference than other tools. This gives SNAP up to 2x lower error rates than existing tools (in some cases) and lets it match larger mutations that they may miss. SNAP also natively reads BAM, FASTQ, or gzipped FASTQ, and natively writes SAM or BAM, with built-in sorting, duplicate marking, and BAM indexing.

その他の snap-aligner 関連パッケージ

  • 依存
  • 推奨
  • 提案
  • dep: libc6 (>= 2.34)
    GNU C Library: Shared libraries
    以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
  • dep: libgcc-s1 (>= 4.0)
    GCC support library
  • dep: libstdc++6 (>= 5.2)
    GNU Standard C++ Library v3
  • dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.4)
    compression library - runtime

snap-aligner のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ パッケージサイズ インストールサイズ ファイル
arm64 754.2 kB1259 kB [ファイル一覧]