[ ソース: canu ]
パッケージ: canu (2.0+dfsg-2)
canu に関するリンク
Trisquel の資源:
canu ソースパッケージをダウンロード:
メンテナ:
Original Maintainer:
- Debian Med Packaging Team (メールアーカイブ)
外部の資源:
- ホームページ [canu.readthedocs.org]
類似のパッケージ:
single molecule sequence assembler for genomes
Canu is a fork of the Celera Assembler, designed for high-noise single-molecule sequencing (such as the PacBio RS II or Oxford Nanopore MinION).
Canu is a hierarchical assembly pipeline which runs in four steps:
* Detect overlaps in high-noise sequences using MHAP * Generate corrected sequence consensus * Trim corrected sequences * Assemble trimmed corrected sequences
その他の canu 関連パッケージ
|
|
|
-
- dep: gnuplot
- Command-line driven interactive plotting program.
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU C Library: Shared libraries
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
-
- dep: libfilesys-df-perl
- Module to obtain filesystem disk space information
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5)
- GCC support library
-
- dep: libgomp1 (>= 6)
- GCC OpenMP (GOMP) support library
-
- dep: libstdc++6 (>= 11)
- GNU Standard C++ Library v3
-
- dep: mhap
- locality-sensitive hashing to detect long-read overlaps
-
- dep: perl
- Larry Wall's Practical Extraction and Report Language
-
- sug: nanopolish
- consensus caller for nanopore sequencing data
-
- sug: pbgenomicconsensus
- パッケージは利用できません