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aramo  ]
[ ソース: r-bioc-demixt  ]

パッケージ: r-bioc-demixt (1.10.0-1)

Cell type-specific deconvolution of heterogeneous tumor samples

When studying cancer cells from tumors excised from patients, the samples will be a mixture of tumors and healthy cells, e.g. from invading immune cells. For comparing samples, the interest may be more on comparing the transcriptome of the tumors themselves.

This package prepares the statistical separation (deconvolution) of RNAseq or microarray generated expression data for two or three components.

その他の r-bioc-demixt 関連パッケージ

  • 依存
  • 推奨
  • 提案
  • dep: libc6 (>= 2.29)
    GNU C Library: Shared libraries
    以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
  • dep: libgcc-s1 (>= 3.5)
    GCC support library
  • dep: libgomp1 (>= 4.9)
    GCC OpenMP (GOMP) support library
  • dep: libstdc++6 (>= 5.2)
    GNU Standard C++ Library v3
  • dep: r-api-4.0
    以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: r-base-core
  • dep: r-api-bioc-3.14
    以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: r-bioc-biocgenerics
  • dep: r-base-core (>= 4.1.2-1ubuntu1)
    GNU R core of statistical computation and graphics system
  • dep: r-bioc-summarizedexperiment
    BioConductor assay container
  • dep: r-cran-base64enc
    GNU R package that provides tools for base64 encoding
  • dep: r-cran-ggplot2
    implementation of the Grammar of Graphics
  • dep: r-cran-kernsmooth
    GNU R package for kernel smoothing and density estimation
  • dep: r-cran-knitr
    GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming
  • dep: r-cran-matrixcalc
    GNU R functions for matrix calculations -- matrixcalc
  • dep: r-cran-matrixstats
    GNU R methods that apply to rows and columns of a matrix
  • dep: r-cran-rcpp (>= 1.0.0)
    GNU R package for Seamless R and C++ Integration
  • dep: r-cran-rmarkdown
    convert R markdown documents into a variety of formats
  • dep: r-cran-truncdist
    GNU R functions for truncated random variables

r-bioc-demixt のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ パッケージサイズ インストールサイズ ファイル
armhf 4,446.5 kB4848 kB [ファイル一覧]