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[ ソース: python-gffutils  ]

パッケージ: python3-gffutils (0.10.1-2)

Work with GFF and GTF files in a flexible database framework

A Python package for working with and manipulating the GFF and GTF format files typically used for genomic annotations. Files are loaded into a sqlite3 database, allowing much more complex manipulation of hierarchical features (e.g., genes, transcripts, and exons) than is possible with plain-text methods alone.

その他の python3-gffutils 関連パッケージ

  • 依存
  • 推奨
  • 提案
  • dep: python3
    interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
  • dep: python3-argcomplete
    bash tab completion for argparse (for Python 3)
  • dep: python3-argh
    simple argparse wrapper (Python 3)
  • dep: python3-biopython
    Python3 library for bioinformatics
  • dep: python3-pyfaidx
    efficient random access to fasta subsequences for Python 3
  • dep: python3-simplejson
    simple, fast, extensible JSON encoder/decoder for Python 3.x
  • dep: python3-six (>= 1.12.0)
    Python 2 and 3 compatibility library (Python 3 interface)

python3-gffutils のダウンロード

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アーキテクチャ パッケージサイズ インストールサイズ ファイル
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