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[ ソース: cassiopee  ]

パッケージ: cassiopee (1.0.9-3build1)

index and search tool in genomic sequences

Cassiopee index and search library C implementation. It is a complete rewrite of the ruby Cassiopee gem. It scans an input genomic sequence (dna/rna/protein) and search for a subsequence with exact match or allowing substitutions (Hamming distance) and/or insertion/deletions.

This package contains the cassiopee and cassiopeeknife tools.

その他の cassiopee 関連パッケージ

  • 依存
  • 推奨
  • 提案
  • dep: libc6 (>= 2.4)
    GNU C Library: Shared libraries
    以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
  • dep: libcassie1v5 (>= 1.0.9)
    library implementating search algorithms
  • dep: libgcc-s1 (>= 3.5)
    GCC support library
  • dep: libgoogle-glog0v5
    library that implements application-level logging.
  • dep: libstdc++6 (>= 5.2)
    GNU Standard C++ Library v3

cassiopee のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ パッケージサイズ インストールサイズ ファイル
armhf 14.2 kB52 kB [ファイル一覧]