パッケージ: spoa (4.0.7+ds-2)

spoa に関するリンク

Trisquel の資源:

spoa ソースパッケージをダウンロード:

メンテナ:

Debian Med Packaging Team (メールアーカイブ)

Original Maintainers:

Debian Med Packaging Team (メールアーカイブ)
Andreas Tille

外部の資源:

ホームページ [github.com]

類似のパッケージ:

SIMD partial order alignment tool

Spoa (SIMD POA) is a c++ implementation of the partial order alignment (POA) algorithm (as described in 10.1093/bioinformatics/18.3.452) which is used to generate consensus sequences (as described in 10.1093/bioinformatics/btg109). It supports three alignment modes: local (Smith-Waterman), global (Needleman-Wunsch) and semi-global alignment (overlap).

その他の spoa 関連パッケージ

依存

推奨

提案

dep: libc6 (>= 2.34)

GNU C Library: Shared libraries
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.5)

GCC support library
dep: libspoa7.0.0 (>= 4.0.7+ds)

SIMD partial order alignment library
dep: libstdc++6 (>= 11)

GNU Standard C++ Library v3
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

compression library - runtime

spoa のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
armhf	33.8 kB	61 kB	[ファイル一覧]

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