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パッケージ: tophat-recondition (1.4-3)

tophat-recondition に関するリンク

tophat-recondition

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外部の資源:

類似のパッケージ:

post-processor for TopHat unmapped reads

tophat-recondition is a post-processor for TopHat unmapped reads (contained in unmapped.bam), making them compatible with downstream tools (e.g., the Picard suite, samtools, GATK) (TopHat issue #17). It also works around bugs in TopHat:

 * the "mate is unmapped" SAM flag is not set on any reads in the
   unmapped.bam file (TopHat issue #3)
 * the mapped mate of an unmapped read can be absent from
   accepted_hits.bam, creating a mismatch between the file and the unmapped
   read's flags (TopHat issue #16)

その他の tophat-recondition 関連パッケージ

  • 依存
  • 推奨
  • 提案
  • dep: python3
    interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
  • sug: tophat2
    パッケージは利用できません

tophat-recondition のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
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