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パッケージ: maq (0.7.1-9)

maq に関するリンク

maq

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類似のパッケージ:

maps short fixed-length polymorphic DNA sequence reads to reference sequences

Maq (short for Mapping and Assembly with Quality) builds mapping assemblies from short reads generated by the next-generation sequencing machines. It was particularly designed for Illumina-Solexa 1G Genetic Analyzer, and has a preliminary functionality to handle ABI SOLiD data. Maq is previously known as mapass2.

Developmemt of Maq stopped in 2008. Its successors are BWA and SAMtools.

その他の maq 関連パッケージ

  • 依存
  • 推奨
  • 提案
  • dep: libc6 (>= 2.29)
    GNU C Library: Shared libraries
    以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
  • dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]
    GCC support library
    dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [arm64, ppc64el]
  • dep: libstdc++6 (>= 5)
    GNU Standard C++ Library v3
  • dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)
    compression library - runtime
  • sug: bwa
    Burrows-Wheeler Aligner
  • sug: samtools
    processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

maq のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ パッケージサイズ インストールサイズ ファイル
amd64 273.4 kB520 kB [ファイル一覧]
arm64 264.2 kB496 kB [ファイル一覧]
armhf 264.4 kB451 kB [ファイル一覧]
ppc64el 298.3 kB624 kB [ファイル一覧]