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パッケージ: python3-htseq (2.0.5-1build1)

python3-htseq に関するリンク

python3-htseq

Trisquel の資源:

htseq ソースパッケージをダウンロード:

メンテナ:

Original Maintainers:

外部の資源:

類似のパッケージ:

Python3 high-throughput genome sequencing read analysis utilities

HTSeq can be used to performing a number of common analysis tasks when working with high-throughput genome sequencing reads:

  * Getting statistical summaries about the base-call quality scores to
    study the data quality.
  * Calculating a coverage vector and exporting it for visualization in
    a genome browser.
  * Reading in annotation data from a GFF file.
  * Assigning aligned reads from an RNA-Seq experiments to exons and
    genes.

This package contains the Python 3 module.

その他の python3-htseq 関連パッケージ

  • 依存
  • 推奨
  • 提案
  • dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
    GNU C Library: Shared libraries
    以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
    dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]
    dep: libc6 (>= 2.4) [armhf]
  • dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [riscv64]
    GCC support library
    dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [armhf, riscv64 以外]
    dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]
  • dep: libstdc++6 (>= 13.1)
    GNU Standard C++ Library v3
  • dep: python3
    interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
    dep: python3 (<< 3.13)
    dep: python3 (>= 3.12~)
  • dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0)
    Fast array facility to the Python language (Python 3)
  • dep: python3-numpy-abi9
    以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: python3-numpy
  • dep: python3-pysam
    interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)

python3-htseq のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ パッケージサイズ インストールサイズ ファイル
amd64 311.4 kB1054 kB [ファイル一覧]
arm64 295.7 kB1033 kB [ファイル一覧]
armhf 292.2 kB773 kB [ファイル一覧]
ppc64el 333.5 kB1289 kB [ファイル一覧]
riscv64 318.7 kB909 kB [ファイル一覧]