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[ ソース: dascrubber  ]

パッケージ: dascrubber (0~20180108-1)

dascrubber に関するリンク

dascrubber

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メンテナ:

Original Maintainers:

外部の資源:

類似のパッケージ:

alignment-based scrubbing pipeline for DNA sequencing reads

The Dazzler Scrubbing Suite produces a set of edited reads that are guaranteed to 

 * be continuous stretches of the underlying genome (i.e. no unremoved
   adapters and not chimers)
 * have no very low quality stretches (i.e. the error rate never exceeds some
   reasonable maximum, 20% or so in the case of Pacbio data).
Its secondary goal is to do so with the minimum removal of data and splitting of reads.

その他の dascrubber 関連パッケージ

  • 依存
  • 推奨
  • 提案
  • dep: libc6 (>= 2.7)
    GNU C Library: Shared libraries
    以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
  • sug: daligner
    local alignment discovery between long nucleotide sequencing reads
  • sug: dazzdb
    manage nucleotide sequencing read data

dascrubber のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ パッケージサイズ インストールサイズ ファイル
amd64 147.1 kB982 kB [ファイル一覧]
i386 142.0 kB1066 kB [ファイル一覧]