[ ソース: stacks ]
パッケージ: stacks-web (2.0Beta8c+dfsg-1)
stacks-web に関するリンク
Trisquel の資源:
stacks ソースパッケージをダウンロード:
- [stacks_2.0Beta8c+dfsg-1.dsc]
- [stacks_2.0Beta8c+dfsg.orig.tar.xz]
- [stacks_2.0Beta8c+dfsg-1.debian.tar.xz]
メンテナ:
Original Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (メールアーカイブ)
- Tim Booth
- Andreas Tille
外部の資源:
- ホームページ [creskolab.uoregon.edu]
類似のパッケージ:
web interface for displaying loci from short-read sequences
Stacks is a software pipeline for building loci from short-read sequences, such as those generated on the Illumina platform. Stacks was developed to work with restriction enzyme-based data, such as RAD-seq, for the purpose of building genetic maps and conducting population genomics and phylogeography.
This package provides the web-based viewer which you can use to examine Stacks output that has been loaded into a MySQL database.
その他の stacks-web 関連パッケージ
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- dep: apache2
- Apache HTTP Server
- または httpd
- 以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: aolserver4-core, aolserver4-daemon, apache2, ebhttpd, lighttpd, micro-httpd, mini-httpd, nginx-core, nginx-extras, nginx-full, nginx-light, tntnet, webfs, yaws
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- dep: default-mysql-server
- MySQL database server binaries and system database setup (metapackage)
- または virtual-mysql-server
- 以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: mariadb-server-10.1, mysql-server-5.7, percona-xtradb-cluster-server-5.7
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- dep: libapache2-mod-php
- server-side, HTML-embedded scripting language (Apache 2 module) (default)
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libapache2-mod-php7.2 - または php-cgi
- server-side, HTML-embedded scripting language (CGI binary) (default)
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: php7.2-cgi
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- dep: libdbd-mysql-perl
- Perl5 database interface to the MariaDB/MySQL database
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- dep: php-mdb2-driver-mysql
- mysql MDB2 driver
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- rec: stacks
- pipeline for building loci from short-read DNA sequences