Skip to content
Sections
>> Trisquel >> パッケージ >> nabia >> science >> disulfinder
etiona  ] [  nabia  ] [  aramo  ]
[ ソース: disulfinder  ]

パッケージ: disulfinder (1.2.11-8build1)

disulfinder に関するリンク

disulfinder

Trisquel の資源:

disulfinder ソースパッケージをダウンロード:

メンテナ:

Original Maintainers:

外部の資源:

類似のパッケージ:

cysteines disulfide bonding state and connectivity predictor

'disulfinder' is for predicting the disulfide bonding state of cysteines and their disulfide connectivity starting from sequence alone. Disulfide bridges play a major role in the stabilization of the folding process for several proteins. Prediction of disulfide bridges from sequence alone is therefore useful for the study of structural and functional properties of specific proteins. In addition, knowledge about the disulfide bonding state of cysteines may help the experimental structure determination process and may be useful in other genomic annotation tasks.

'disulfinder' predicts disulfide patterns in two computational stages: (1) the disulfide bonding state of each cysteine is predicted by a BRNN-SVM binary classifier; (2) cysteines that are known to participate in the formation of bridges are paired by a Recursive Neural Network to obtain a connectivity pattern.

その他の disulfinder 関連パッケージ

  • 依存
  • 推奨
  • 提案
  • dep: disulfinder-data
    data files for predictor of disulfide bonds in proteins
  • dep: libc6 (>= 2.29)
    GNU C Library: Shared libraries
    以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
  • dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64]
    GCC support library
    dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]
  • dep: libstdc++6 (>= 5.2)
    GNU Standard C++ Library v3

disulfinder のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ パッケージサイズ インストールサイズ ファイル
amd64 237.6 kB661 kB [ファイル一覧]
armhf 191.0 kB380 kB [ファイル一覧]