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パッケージ: r-bioc-multtest (2.42.0-1)

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r-bioc-multtest

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メンテナ:

Original Maintainers:

  • Debian R Packages Maintainers
  • Andreas Tille

外部の資源:

類似のパッケージ:

Bioconductor resampling-based multiple hypothesis testing

Non-parametric bootstrap and permutation resampling-based multiple testing procedures (including empirical Bayes methods) for controlling the family-wise error rate (FWER), generalized family-wise error rate (gFWER), tail probability of the proportion of false positives (TPPFP), and false discovery rate (FDR). Several choices of bootstrap-based null distribution are implemented (centered, centered and scaled, quantile-transformed). Single-step and step-wise methods are available. Tests based on a variety of t- and F-statistics (including t-statistics based on regression parameters from linear and survival models as well as those based on correlation parameters) are included. When probing hypotheses with t-statistics, users may also select a potentially faster null distribution which is multivariate normal with mean zero and variance covariance matrix derived from the vector influence function. Results are reported in terms of adjusted p-values, confidence regions and test statistic cutoffs. The procedures are directly applicable to identifying differentially expressed genes in DNA microarray experiments.

その他の r-bioc-multtest 関連パッケージ

  • 依存
  • 推奨
  • 提案
  • dep: libc6 (>= 2.29)
    GNU C Library: Shared libraries
    以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
  • dep: r-api-3.5
    以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: r-base-core
  • dep: r-api-bioc-3.10
    以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: r-bioc-biocgenerics
  • dep: r-base-core (>= 3.6.1-7)
    GNU R core of statistical computation and graphics system
  • dep: r-bioc-biobase
    base functions for Bioconductor
  • dep: r-bioc-biocgenerics
    generic functions for Bioconductor
  • dep: r-cran-mass
    GNU R package of Venables and Ripley's MASS
  • dep: r-cran-survival
    GNU R package for survival analysis
  • sug: r-cran-snow
    GNU R package for 'simple network of workstations'

r-bioc-multtest のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ パッケージサイズ インストールサイズ ファイル
amd64 824.2 kB1063 kB [ファイル一覧]
armhf 820.6 kB1047 kB [ファイル一覧]