Pakiet: barrnap (0.9+dfsg-2)
Odnośniki dla barrnap
Zasoby systemu Trisquel:
- Install using apturl
- Entry at directory.fsf.org
- Raporty o błędach
- Changelog
- Informacje nt. praw autorskich
Pobieranie pakietu źródłowego barrnap:
Opiekun:
Original Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (Archiwum e-mail)
- Sascha Steinbiss
Zasoby zewnętrzne:
- Strona internetowa [www.vicbioinformatics.com]
Podobne pakiety:
rapid ribosomal RNA prediction
Barrnap (BAsic Rapid Ribosomal RNA Predictor) predicts the location of ribosomal RNA genes in genomes. It supports bacteria (5S,23S,16S), archaea (5S,5.8S,23S,16S), mitochondria (12S,16S) and eukaryotes (5S,5.8S,28S,18S).
It takes FASTA DNA sequence as input, and writes GFF3 as output. It uses the NHMMER tool that comes with HMMER 3.1 for HMM searching in RNA:DNA style. Multithreading is supported and one can expect roughly linear speed-ups with more CPUs.
Inne pakiety związane z barrnap
|
|
|
Pobieranie barrnap
Architektura | Rozmiar pakietu | Rozmiar po instalacji | Pliki |
---|---|---|---|
all | 199,4 KiB | 1440 KiB | [lista plików] |