Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Pakiety >> aramo >> science >> kleborate-examples
[  nabia  ] [  aramo  ]
[ Pakiet źródłowy: kleborate  ]

Pakiet: kleborate-examples (2.2.0-1)

Odnośniki dla kleborate-examples

kleborate-examples

Zasoby systemu Trisquel:

Pobieranie pakietu źródłowego kleborate:

Opiekun:

Original Maintainers:

  • Debian Med Packaging Team (Archiwum e-mail)
  • Andreas Tille
  • Étienne Mollier

Zasoby zewnętrzne:

Podobne pakiety:

tool to screen Klebsiella genome assemblies (example data)

Kleborate is a tool to screen Klebsiella genome assemblies for: 

 * MLST sequence type
 * species (e.g. K. pneumoniae, K. quasipneumoniae, K. variicola, etc.)
 * ICEKp associated virulence loci: yersiniabactin (ybt),
   colibactin (clb)
 * virulence plasmid associated loci: salmochelin (iro), aerobactin
   (iuc), hypermucoidy (rmpA, rmpA2)
 * antimicrobial resistance genes, including quinolone resistance SNPs
   and colistin resistance truncations
 * K (capsule) and O antigen (LPS) serotype prediction, via wzi alleles
   and Kaptive

This package provides example data end tests that are used in autopkgtest.

Inne pakiety związane z kleborate-examples

  • wymaga
  • poleca
  • sugeruje
  • rec: kleborate
    tool to screen Klebsiella genome assemblies

Pobieranie kleborate-examples

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
all 5 848,7 KiB5862 KiB [lista plików]