Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Pakiety >> aramo >> science >> fml-asm
etiona  ] [  nabia  ] [  aramo  ]
[ Pakiet źródłowy: fermi-lite  ]

Pakiet: fml-asm (0.1+git20190320.b499514-1)

tool for assembling Illumina short reads in small regions

Fml-asm is a command-line tool for assembling Illumina short reads in regions from 100bp to 10 million bp in size, based on the fermi-lite library. It is largely a light-weight in-memory version of fermikit without generating any intermediate files. It inherits the performance, the relatively small memory footprint and the features of fermikit. In particular, fermi-lite is able to retain heterozygous events and thus can be used to assemble diploid regions for the purpose of variant calling.

Inne pakiety związane z fml-asm

  • wymaga
  • poleca
  • sugeruje
  • dep: libc6 (>= 2.17)
    GNU C Library: Shared libraries
    również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
  • dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
    compression library - runtime

Pobieranie fml-asm

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
arm64 61,1 KiB143 KiB [lista plików]