Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Pakiety >> aramo >> science >> samtools
[  etiona  ] [  nabia  ] [  aramo  ]
[ Pakiet źródłowy: samtools  ]

Pakiet: samtools (1.13-4)

Odnośniki dla samtools

samtools

Zasoby systemu Trisquel:

Pobieranie pakietu źródłowego samtools:

Opiekun:

Original Maintainers:

  • Debian Med Packaging Team (Archiwum e-mail)
  • Charles Plessy
  • Andreas Tille
  • Étienne Mollier

Zasoby zewnętrzne:

Podobne pakiety:

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Samtools is a set of utilities that manipulate nucleotide sequence alignments in the binary BAM format. It imports from and exports to the ascii SAM (Sequence Alignment/Map) and CRAM formats, does sorting, merging and indexing, and allows one to retrieve reads in any regions swiftly. It is designed to work on a stream, and is able to open a BAM or CRAM (not SAM) file on a remote FTP or HTTP server.

Inne pakiety związane z samtools

  • wymaga
  • poleca
  • sugeruje
  • dep: libc6 (>= 2.34)
    GNU C Library: Shared libraries
    również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
  • dep: libhts3 (>= 1.13)
    C library for high-throughput sequencing data formats
  • dep: libncurses6 (>= 6)
    shared libraries for terminal handling
  • dep: libtinfo6 (>= 6)
    shared low-level terminfo library for terminal handling
  • dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
    compression library - runtime
  • sug: cwltool
    Common Workflow Language reference implementation

Pobieranie samtools

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
arm64 506,2 KiB1095 KiB [lista plików]