Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Pakiety >> aramo >> science >> hmmer
etiona  ] [  nabia  ] [  aramo  ]
[ Pakiet źródłowy: hmmer  ]

Pakiet: hmmer (3.3.2+dfsg-1)

profile hidden Markov models for protein sequence analysis

HMMER is an implementation of profile hidden Markov model methods for sensitive searches of biological sequence databases using multiple sequence alignments as queries.

Given a multiple sequence alignment as input, HMMER builds a statistical model called a "hidden Markov model" which can then be used as a query into a sequence database to find (and/or align) additional homologues of the sequence family.

Inne pakiety związane z hmmer

  • wymaga
  • poleca
  • sugeruje
  • dep: libc6 (>= 2.29)
    GNU C Library: Shared libraries
    również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
  • dep: libdivsufsort3 (>= 2.0.1)
    fast suffix array construction
  • sug: hmmer-doc (>= 3.3.2+dfsg-1)
    profile hidden Markov models for protein sequence analysis (docs)

Pobieranie hmmer

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
amd64 1 128,3 KiB7327 KiB [lista plików]