Pakiet: python3-cyvcf2 (0.30.14-1build1)

Odnośniki dla python3-cyvcf2

Zasoby systemu Trisquel:

Pobieranie pakietu źródłowego cyvcf2:

Opiekun:

Debian Med Packaging Team (Archiwum e-mail)

Original Maintainers:

Debian Med Packaging Team (Archiwum e-mail)
Steffen Moeller
Liubov Chuprikova
Nilesh Patra

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [github.com]

Podobne pakiety:

VCF parser based on htslib (Python 3)

This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.

cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.

This package installs the library for Python 3.

Inne pakiety związane z python3-cyvcf2

wymaga

poleca

sugeruje

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

GNU C Library: Shared libraries
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.7) [armhf]
dep: libhts3 (>= 1.10)

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

dep: python3 (<< 3.11)

dep: python3 (>= 3.10~)
dep: python3-click

Wrapper around optparse for command line utilities - Python 3.x
dep: python3-coloredlogs

colored terminal output for Python 3's logging module
dep: python3-numpy (>= 1:1.20.0)

Fast array facility to the Python 3 language
dep: python3-numpy-abi9

pakiet wirtualny udostępniany przez python3-numpy

Pobieranie python3-cyvcf2

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	817,0 KiB	4733 KiB	[lista plików]
arm64	806,8 KiB	4671 KiB	[lista plików]
armhf	794,9 KiB	4455 KiB	[lista plików]
ppc64el	874,8 KiB	5036 KiB	[lista plików]

Sections