Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Pakiety >> aramo >> science >> amap-align
etiona  ] [  nabia  ] [  aramo  ]
[ Pakiet źródłowy: amap-align  ]

Pakiet: amap-align (2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2)

Protein multiple alignment by sequence annealing

AMAP is a command line tool to perform multiple alignment of peptidic sequences. It utilizes posterior decoding, and a sequence-annealing alignment, instead of the traditional progressive alignment method. It is the only alignment program that allows one to control the sensitivity / specificity tradeoff. It is based on the ProbCons source code, but uses alignment metric accuracy and eliminates the consistency transformation.

The Java visualisation tool of AMAP 2.2 is not yet packaged in Debian.

Inne pakiety związane z amap-align

  • wymaga
  • poleca
  • sugeruje
  • dep: libc6 (>= 2.27)
    GNU C Library: Shared libraries
    również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
  • dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armhf]
    GCC support library
    dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]
  • dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armhf]
    GNU Standard C++ Library v3
    dep: libstdc++6 (>= 9) [nie armhf]

Pobieranie amap-align

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
amd64 129,9 KiB1219 KiB [lista plików]
arm64 121,5 KiB1178 KiB [lista plików]
armhf 107,2 KiB1118 KiB [lista plików]
ppc64el 139,6 KiB1230 KiB [lista plików]