Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Pakiety >> aramo >> science >> meryl
etiona  ] [  aramo  ]
[ Pakiet źródłowy: kmer  ]

Pakiet: meryl (0~20150903+r2013-8build2)

in- and out-of-core kmer counting and utilities

meryl computes the kmer content of genomic sequences. Kmer content is represented as a list of kmers and the number of times each occurs in the input sequences. The kmer can be restricted to only the forward kmer, only the reverse kmer, or the canonical kmer (lexicographically smaller of the forward and reverse kmer at each location). Meryl can report the histogram of counts, the list of kmers and their counts, or can perform mathematical and set operations on the processed data files.

This package is part of the Kmer suite.

Inne pakiety związane z meryl

  • wymaga
  • poleca
  • sugeruje
  • dep: libc6 (>= 2.34)
    GNU C Library: Shared libraries
    również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
  • dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [nie armhf]
    GCC support library
    dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]
  • dep: libstdc++6 (>= 5)
    GNU Standard C++ Library v3

Pobieranie meryl

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
amd64 195,5 KiB809 KiB [lista plików]
arm64 213,2 KiB721 KiB [lista plików]
armhf 222,8 KiB1239 KiB [lista plików]
ppc64el 235,9 KiB1013 KiB [lista plików]