Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Pakiety >> aramo >> science >> spoa
[  nabia  ] [  aramo  ]
[ Pakiet źródłowy: spoa  ]

Pakiet: spoa (4.0.7+ds-2)

SIMD partial order alignment tool

Spoa (SIMD POA) is a c++ implementation of the partial order alignment (POA) algorithm (as described in 10.1093/bioinformatics/18.3.452) which is used to generate consensus sequences (as described in 10.1093/bioinformatics/btg109). It supports three alignment modes: local (Smith-Waterman), global (Needleman-Wunsch) and semi-global alignment (overlap).

Inne pakiety związane z spoa

  • wymaga
  • poleca
  • sugeruje
  • dep: libc6 (>= 2.34)
    GNU C Library: Shared libraries
    również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
  • dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armhf]
    GCC support library
    dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]
  • dep: libspoa7.0.0 (>= 4.0.5+ds) [amd64]
    SIMD partial order alignment library
    dep: libspoa7.0.0 (>= 4.0.7+ds) [nie amd64]
  • dep: libstdc++6 (>= 11)
    GNU Standard C++ Library v3
  • dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
    compression library - runtime

Pobieranie spoa

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
amd64 36,5 KiB82 KiB [lista plików]
arm64 35,8 KiB74 KiB [lista plików]
armhf 33,8 KiB61 KiB [lista plików]
ppc64el 37,9 KiB98 KiB [lista plików]