Pakiet: python3-pairtools (1.0.3-1build1)

Odnośniki dla python3-pairtools

Zasoby systemu Trisquel:

Pobieranie pakietu źródłowego pairtools:

Opiekun:

Debian Med Packaging Team (Archiwum e-mail)

Original Maintainers:

Debian Med Packaging Team (Archiwum e-mail)
Antoni Villalonga

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [github.com]

Podobne pakiety:

Framework to process sequencing data from a Hi-C experiment

Simple and fast command-line framework to process sequencing data from a Hi-C experiment.

Process pair-end sequence alignments and perform the following operations:

  - Detect ligation junctions (a.k.a. Hi-C pairs) in aligned paired-end
    sequences of Hi-C DNA molecules
  - Sort .pairs files for downstream analyses
  - Detect, tag and remove PCR/optical duplicates
  - Generate extensive statistics of Hi-C datasets
  - Select Hi-C pairs given flexibly defined criteria
  - Restore .sam alignments from Hi-C pairs

Inne pakiety związane z python3-pairtools

wymaga

poleca

sugeruje

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

GNU C Library: Shared libraries
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

dep: libc6 (>= 2.4) [armhf]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [riscv64]

GCC support library

dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [nie armhf, riscv64]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]
dep: libstdc++6 (>= 11)

GNU Standard C++ Library v3
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

dep: python3 (<< 3.13)

dep: python3 (>= 3.12~)
dep: python3-bioframe

library to enable flexible, scalable operations on genomic interval dataframes
dep: python3-click

Wrapper around optparse for command line utilities - Python 3.x
dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0)

Fast array facility to the Python language (Python 3)
dep: python3-numpy-abi9

pakiet wirtualny udostępniany przez python3-numpy
dep: python3-pandas

data structures for "relational" or "labeled" data
dep: python3-pysam (>= 0.20.0+ds-3~)

interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)
dep: python3-scipy

scientific tools for Python 3
dep: python3-yaml

YAML parser and emitter for Python3

sug: python3-pairtools-examples (>= 1.0.2)

Process sequencing data from a Hi-C experiment (examples)

Pobieranie python3-pairtools

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	196,0 KiB	775 KiB	[lista plików]
arm64	188,0 KiB	889 KiB	[lista plików]
armhf	181,4 KiB	613 KiB	[lista plików]
ppc64el	220,8 KiB	953 KiB	[lista plików]
riscv64	195,3 KiB	693 KiB	[lista plików]

Sections