Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Pakiety >> etiona >> science >> swarm
etiona  ] [  nabia  ] [  aramo  ]
[ Pakiet źródłowy: swarm-cluster  ]

Pakiet: swarm (2.2.2+dfsg-1)

robust and fast clustering method for amplicon-based studies

The purpose of swarm is to provide a novel clustering algorithm to handle large sets of amplicons. Traditional clustering algorithms results are strongly input-order dependent, and rely on an arbitrary global clustering threshold. swarm results are resilient to input-order changes and rely on a small local linking threshold d, the maximum number of differences between two amplicons. swarm forms stable high-resolution clusters, with a high yield of biological information.

Inne pakiety związane z swarm

  • wymaga
  • poleca
  • sugeruje
  • dep: libc6 (>= 2.14)
    GNU C Library: Shared libraries
    również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
  • dep: libgcc1 (>= 1:3.0)
    GCC support library
  • dep: libstdc++6 (>= 4.1.1)
    GNU Standard C++ Library v3
  • rec: python
    interactive high-level object-oriented language (default version)

Pobieranie swarm

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
amd64 75,9 KiB207 KiB [lista plików]