Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Pakiety >> etiona >> libs >> libgkarrays1
etiona  ] [  nabia  ] [  aramo  ]
[ Pakiet źródłowy: libgkarrays  ]

Pakiet: libgkarrays1 (2.1.0+dfsg-1)

library to query large collection of NGS sequences

Gk-arrays are provided as a simple-to-use C++ library dedicated to queries on large collection of sequences as produced by high-throughput sequencers (e.g. HiSeq 2000 from Illumina, 454 from Roche).

Gk-arrays index k-mers of reads and allows one to answer different queries on that read collection (e.g. how many reads share this k-mer? where does this k-mer occur in the read collection?).

Gk-arrays consist of a space-efficient alternative to hash tables while being similar in terms of query times.

Inne pakiety związane z libgkarrays1

  • wymaga
  • poleca
  • sugeruje
  • dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
    GNU C Library: Shared libraries
    również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.4) [i386]
  • dep: libgcc1 (>= 1:3.0)
    GCC support library
  • dep: libstdc++6 (>= 5.2)
    GNU Standard C++ Library v3
  • dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
    compression library - runtime

Pobieranie libgkarrays1

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
amd64 47,6 KiB145 KiB [lista plików]
i386 59,5 KiB172 KiB [lista plików]