Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Pakiety >> etiona >> science >> seqtk
etiona  ] [  nabia  ] [  aramo  ]
[ Pakiet źródłowy: seqtk  ]

Pakiet: seqtk (1.2-2)

Fast and lightweight tool for processing sequences in the FASTA or FASTQ format

Currently, seqtk supports quality based trimming with the phred algorithm, converting fastq to fasta, reverse complementing sequences, extracting or masking subsequences in regions given in a BED/name list file, and more. It contains a subsampling module to sample exactly n sequences or a fraction of sequences.

Seqtk supports both fasta and fastq input files, which can be optionally gzip compressed.

Inne pakiety związane z seqtk

  • wymaga
  • poleca
  • sugeruje
  • dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
    GNU C Library: Shared libraries
    również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.4) [i386]
  • dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
    compression library - runtime

Pobieranie seqtk

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
amd64 29,8 KiB79 KiB [lista plików]
i386 32,4 KiB87 KiB [lista plików]