Pakiet: murasaki-common (1.68.6-9build2)

Odnośniki dla murasaki-common

Zasoby systemu Trisquel:

Pobieranie pakietu źródłowego murasaki:

Opiekun:

Debian Med Packaging Team (Archiwum e-mail)

Original Maintainers:

Debian Med Packaging Team (Archiwum e-mail)
Andreas Tille

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [murasaki.dna.bio.keio.ac.jp]

Podobne pakiety:

homology detection tool across multiple large genomes (common files)

Murasaki is a scalable and fast, language theory-based homology detection tool across multiple large genomes. It enable whole-genome scale multiple genome global alignments. Supports unlimited length gapped-seed patterns and unique TF-IDF based filtering.

Murasaki is an anchor alignment software, which is

 * exteremely fast (17 CPU hours for whole Human x Mouse genome (with
   40 nodes: 52 wall minutes))
 * scalable (Arbitrarily parallelizable across multiple nodes using MPI.
   Even a single node with 16GB of ram can handle over 1Gbp of sequence.)
 * unlimited pattern length
 * repeat tolerant
 * intelligent noise reduction

This package contains all files that are common to the single core murasaki package and the multi core murasaki-mpi package.

Inne pakiety związane z murasaki-common

wymaga

poleca

sugeruje

dep: gnuplot

Command-line driven interactive plotting program.
również pakiet wirtualny udostępniany przez gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11

lub gnuplot5

Pakiet niedostępny
dep: imagemagick

image manipulation programs -- binaries
również pakiet wirtualny udostępniany przez graphicsmagick-imagemagick-compat, imagemagick-6.q16
dep: libbio-perl-perl

BioPerl core perl modules
dep: r-cran-rocr

GNU R package to prepare and display ROC curves

rec: libterm-readkey-perl

perl module for simple terminal control
rec: libtext-wrapi18n-perl

internationalized substitute of Text::Wrap

lub libtext-wrapper-perl

simple word wrapping routine

Pobieranie murasaki-common

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
all	141,3 KiB	433 KiB	[lista plików]

Sections