Pakiet: canu (1.9+dfsg-1build1)

Odnośniki dla canu

Zasoby systemu Trisquel:

Pobieranie pakietu źródłowego canu:

Opiekun:

Debian Med Packaging Team (Archiwum e-mail)

Original Maintainer:

Debian Med Packaging Team (Archiwum e-mail)

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [canu.readthedocs.org]

Podobne pakiety:

single molecule sequence assembler for genomes

Canu is a fork of the Celera Assembler, designed for high-noise single-molecule sequencing (such as the PacBio RS II or Oxford Nanopore MinION).

Canu is a hierarchical assembly pipeline which runs in four steps:

 * Detect overlaps in high-noise sequences using MHAP
 * Generate corrected sequence consensus
 * Trim corrected sequences
 * Assemble trimmed corrected sequences

Inne pakiety związane z canu

wymaga

poleca

sugeruje

dep: gnuplot

Command-line driven interactive plotting program.
również pakiet wirtualny udostępniany przez gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11
dep: libc6 (>= 2.29)

GNU C Library: Shared libraries
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
dep: libfilesys-df-perl

Module to obtain filesystem disk space information
dep: libgcc-s1 (>= 3.5)

GCC support library
dep: libgomp1 (>= 6)

GCC OpenMP (GOMP) support library
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

GNU Standard C++ Library v3
dep: mhap (>= 2.1.3)

locality-sensitive hashing to detect long-read overlaps
dep: perl

Larry Wall's Practical Extraction and Report Language

sug: nanopolish

consensus caller for nanopore sequencing data
sug: pbgenomicconsensus

Pakiet niedostępny

Pobieranie canu

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
armhf	1 211,7 KiB	6847 KiB	[lista plików]

Sections