Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Pakiety >> nabia >> science >> maq
etiona  ] [  nabia  ] [  aramo  ]
[ Pakiet źródłowy: maq  ]

Pakiet: maq (0.7.1-8build1)

maps short fixed-length polymorphic DNA sequence reads to reference sequences

Maq (short for Mapping and Assembly with Quality) builds mapping assemblies from short reads generated by the next-generation sequencing machines. It was particularly designed for Illumina-Solexa 1G Genetic Analyzer, and has a preliminary functionality to handle ABI SOLiD data. Maq is previously known as mapass2.

Developmemt of Maq stopped in 2008. Its successors are BWA and SAMtools.

Inne pakiety związane z maq

  • wymaga
  • poleca
  • sugeruje
  • dep: libc6 (>= 2.29)
    GNU C Library: Shared libraries
    również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
  • dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]
    GCC support library
  • dep: libstdc++6 (>= 5)
    GNU Standard C++ Library v3
  • dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)
    compression library - runtime
  • sug: bwa
    Burrows-Wheeler Aligner
  • sug: samtools
    processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Pobieranie maq

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
amd64 281,2 KiB531 KiB [lista plików]
armhf 277,0 KiB462 KiB [lista plików]