Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Pakiety >> nabia >> science >> maqview
etiona  ] [  nabia  ] [  aramo  ]
[ Pakiet źródłowy: maqview  ]

Pakiet: maqview (0.2.5-9build1)

Odnośniki dla maqview

maqview

Zasoby systemu Trisquel:

Pobieranie pakietu źródłowego maqview:

Opiekun:

Original Maintainers:

Zasoby zewnętrzne:

Podobne pakiety:

graphical read alignment viewer for short gene sequences

Maqview is graphical read alignment viewer. It is specifically designed for the Maq alignment file and allows you to see the mismatches, base qualities and mapping qualities. Maqview is nothing fancy as Consed or GAP, but just a simple viewer for you to see what happens in a particular region.

In comparison to tgap-maq, the text-based read alignment viewer written by James Bonfield, Maqview is faster and takes up much less memory and disk space in indexing. This is possibly because tgap aims to be a general-purpose viewer but Maqview fully makes use of the fact that a Maq alignment file has already been sorted. Maqview is also efficient in viewing and provides a command-line tool to quickly retrieve any region in an Maq alignment file.

Inne pakiety związane z maqview

  • wymaga
  • poleca
  • sugeruje
  • dep: freeglut3
    OpenGL Utility Toolkit
  • dep: libc6 (>= 2.15)
    GNU C Library: Shared libraries
    również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
  • dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]
    GCC support library
  • dep: libgl1
    Vendor neutral GL dispatch library -- legacy GL support
  • dep: libglu1-mesa
    Mesa OpenGL utility library (GLU)
    lub libglu1
    pakiet wirtualny udostępniany przez libglu1-mesa
  • dep: libstdc++6 (>= 5)
    GNU Standard C++ Library v3

Pobieranie maqview

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
amd64 107,0 KiB631 KiB [lista plików]
armhf 92,2 KiB394 KiB [lista plików]