Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Пакеты >> aramo >> python >> python3-cyvcf2
nabia  ] [  aramo  ]
[ Источник: cyvcf2  ]

Пакет: python3-cyvcf2 (0.30.14-1build1)

Ссылки для python3-cyvcf2

python3-cyvcf2

Ресурсы Trisquel:

Исходный код cyvcf2:

Сопровождающий:

Original Maintainers:

Внешние ресурсы:

Подобные пакеты:

VCF parser based on htslib (Python 3)

This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.

cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.

This package installs the library for Python 3.

Другие пакеты, относящиеся к python3-cyvcf2

  • зависимости
  • рекомендации
  • предложения
  • dep: libc6 (>= 2.14)
    GNU C Library: Shared libraries
    также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
  • dep: libhts3 (>= 1.10)
    C library for high-throughput sequencing data formats
  • dep: python3
    interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
    dep: python3 (<< 3.11)
    dep: python3 (>= 3.10~)
  • dep: python3-click
    Wrapper around optparse for command line utilities - Python 3.x
  • dep: python3-coloredlogs
    colored terminal output for Python 3's logging module
  • dep: python3-numpy (>= 1:1.20.0)
    Fast array facility to the Python 3 language
  • dep: python3-numpy-abi9
    виртуальный пакет, предоставляемый python3-numpy

Загрузка python3-cyvcf2

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура Размер пакета В установленном виде Файлы
amd64 817,0 Кб4733 Кб [список файлов]