Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Пакеты >> aramo >> science >> gmap
[  nabia  ] [  aramo  ]
[ Источник:  ]

Пакет: gmap (2021-12-17+ds-1)

Ссылки для gmap

gmap

Ресурсы Trisquel:

Исходный код : Не найден

Внешние ресурсы:

Подобные пакеты:

spliced and SNP-tolerant alignment for mRNA and short reads

This package contains the programs GMAP and GSNAP as well as utilities to manage genome databases in GMAP/GSNAP format. GMAP (Genomic Mapping and Alignment Program) is a tool for aligning EST, mRNA and cDNA sequences. GSNAP (Genomic Short-read Nucleotide Alignment Program) is a tool for aligning single-end and paired-end transcriptome reads. Both tools can use a database of 

 * known splice sites and identify novel splice sites.
 * known single-nucleotide polymorphisms (SNPs).
GSNAP can align bisulfite-treated DNA.

Другие пакеты, относящиеся к gmap

  • зависимости
  • рекомендации
  • предложения
  • dep: libbz2-1.0
    high-quality block-sorting file compressor library - runtime
  • dep: libc6 (>= 2.34)
    GNU C Library: Shared libraries
    также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
  • dep: perl
    Larry Wall's Practical Extraction and Report Language
  • dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)
    compression library - runtime

Загрузка gmap

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура Размер пакета В установленном виде Файлы
arm64 5 375,1 Кб42126 Кб [список файлов]