Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Пакеты >> aramo >> science >> nanolyse
[  aramo  ]
[ Источник: nanolyse  ]

Пакет: nanolyse (1.2.0-3)

Ссылки для nanolyse

nanolyse

Ресурсы Trisquel:

Исходный код nanolyse:

Сопровождающий:

Original Maintainers:

Внешние ресурсы:

Подобные пакеты:

remove lambda phage reads from a fastq file

NanoLyse is a tool for rapid removal of contaminant DNA, using the Minimap2 aligner through the mappy Python binding. A typical application would be the removal of the lambda phage control DNA fragment supplied by ONT, for which the reference sequence is included in the package. However, this approach may lead to unwanted loss of reads from regions highly homologous to the lambda phage genome.

Другие пакеты, относящиеся к nanolyse

  • зависимости
  • рекомендации
  • предложения
  • dep: python3
    interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
  • dep: python3-biopython
    Python3 library for bioinformatics
  • dep: python3-mappy
    Python3 interface minimap2

Загрузка nanolyse

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура Размер пакета В установленном виде Файлы
amd64 25,2 Кб66 Кб [список файлов]
arm64 25,2 Кб66 Кб [список файлов]
armhf 25,2 Кб66 Кб [список файлов]
ppc64el 25,2 Кб66 Кб [список файлов]