Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Пакеты >> aramo >> science >> samtools
etiona  ] [  nabia  ] [  aramo  ]
[ Источник: samtools  ]

Пакет: samtools (1.13-4)

Ссылки для samtools

samtools

Ресурсы Trisquel:

Исходный код samtools:

Сопровождающий:

Original Maintainers:

Внешние ресурсы:

Подобные пакеты:

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Samtools is a set of utilities that manipulate nucleotide sequence alignments in the binary BAM format. It imports from and exports to the ascii SAM (Sequence Alignment/Map) and CRAM formats, does sorting, merging and indexing, and allows one to retrieve reads in any regions swiftly. It is designed to work on a stream, and is able to open a BAM or CRAM (not SAM) file on a remote FTP or HTTP server.

Другие пакеты, относящиеся к samtools

  • зависимости
  • рекомендации
  • предложения
  • dep: libc6 (>= 2.34)
    GNU C Library: Shared libraries
    также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
  • dep: libhts3 (>= 1.13)
    C library for high-throughput sequencing data formats
  • dep: libncurses6 (>= 6)
    shared libraries for terminal handling
  • dep: libtinfo6 (>= 6)
    shared low-level terminfo library for terminal handling
  • dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
    compression library - runtime
  • sug: cwltool
    Common Workflow Language reference implementation

Загрузка samtools

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура Размер пакета В установленном виде Файлы
ppc64el 572,7 Кб1687 Кб [список файлов]