Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Пакеты >> aramo >> science >> tabix
etiona  ] [  nabia  ] [  nabia-updates  ] [  aramo  ]
[ Источник: htslib  ]

Пакет: tabix (1.13+ds-2build1)

Ссылки для tabix

tabix

Ресурсы Trisquel:

Исходный код htslib:

Сопровождающий:

Original Maintainers:

Внешние ресурсы:

Подобные пакеты:

generic indexer for TAB-delimited genome position files

Tabix indexes files where some columns indicate sequence coordinates: name (usually a chromosome), start and stop. The input data file must be position sorted and compressed by bgzip (provided in this package), which has a gzip like interface. After indexing, tabix is able to quickly retrieve data lines by chromosomal coordinates. Fast data retrieval also works over network if an URI is given as a file name.

This package is built from the HTSlib source, and provides the bgzip, htsfile, and tabix tools.

Другие пакеты, относящиеся к tabix

  • зависимости
  • рекомендации
  • предложения
  • dep: libbz2-1.0
    high-quality block-sorting file compressor library - runtime
  • dep: libc6 (>= 2.34)
    GNU C Library: Shared libraries
    также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
  • dep: libdeflate0 (>= 1.0)
    fast, whole-buffer DEFLATE-based compression and decompression
  • dep: libhtscodecs2 (>= 1.0)
    Custom compression for CRAM and others
  • dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)
    XZ-format compression library
  • dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
    compression library - runtime

Загрузка tabix

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура Размер пакета В установленном виде Файлы
amd64 342,3 Кб1151 Кб [список файлов]
arm64 335,5 Кб1063 Кб [список файлов]
armhf 312,3 Кб756 Кб [список файлов]
ppc64el 445,3 Кб1727 Кб [список файлов]