[ etiona ]
[ Источник: pbalign ]
Пакет: python-pbalign (0.3.0-1)
Ссылки для python-pbalign
Ресурсы Trisquel:
Исходный код pbalign:
Сопровождающий:
Original Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (Почтовый архив)
- Afif Elghraoui
Внешние ресурсы:
- Сайт [github.com]
Подобные пакеты:
map Pacific Biosciences reads to reference DNA sequences (Python2)
pbalign aligns PacBio reads to reference sequences, filters aligned reads according to user-specific filtering criteria, and converts the output to either the SAM format or PacBio Compare HDF5 (e.g., .cmp.h5) format.
pbalign is part of the SMRTAnalysis suite. This package provides the Python library backend.
Другие пакеты, относящиеся к python-pbalign
|
|
|
-
- dep: blasr (>= 5.3+0)
- mapping single-molecule sequencing reads
-
- dep: python
- interactive high-level object-oriented language (default version)
-
- dep: python-pbcommand
- common command-line interface for Pacific Biosciences analysis modules
-
- dep: python-pbcore
- Python library for processing PacBio data files
-
- dep: python-pysam
- interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 2)
-
- rec: hdf5-tools
- Hierarchical Data Format 5 (HDF5) - Runtime tools
-
- rec: python-pbh5tools
- tools for manipulating Pacific Biosciences HDF5 files -- Python 2 library
-
- sug: bowtie2
- ultrafast memory-efficient short read aligner
-
- sug: gmap
- Пакет недоступен
-
- sug: pbalign-doc
- documentation for pbalign
Загрузка python-pbalign
| Архитектура | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
|---|---|---|---|
| all | 36,3 Кб | 225 Кб | [список файлов] |