[ Источник: mash ]
Пакет: mash (2.0-2)
Ссылки для mash
Ресурсы Trisquel:
Исходный код mash:
Сопровождающий:
Original Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (Почтовый архив)
- Sascha Steinbiss
Внешние ресурсы:
- Сайт [mash.readthedocs.io]
Подобные пакеты:
fast genome and metagenome distance estimation using MinHash
Mash uses MinHash locality-sensitive hashing to reduce large biosequences to a representative sketch and rapidly estimate pairwise distances between genomes or metagenomes. Mash sketch databases effectively delineate known species boundaries, allow construction of approximate phylogenies, and can be searched in seconds using assembled genomes or raw sequencing runs from Illumina, Pacific Biosciences, and Oxford Nanopore. For metagenomics, Mash scales to thousands of samples and can replicate Human Microbiome Project and Global Ocean Survey results in a fraction of the time.
Другие пакеты, относящиеся к mash
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.14)
- GNU C Library: Shared libraries
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
-
- dep: libcapnp-0.6.1
- Cap'n Proto C++ library
-
- dep: libgcc1 (>= 1:3.0)
- GCC support library
-
- dep: libgsl23
- GNU Scientific Library (GSL) -- library package
-
- dep: libgslcblas0
- GNU Scientific Library (GSL) -- blas library package
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU Standard C++ Library v3
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- compression library - runtime
Загрузка mash
| Архитектура | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
|---|---|---|---|
| amd64 | 140,1 Кб | 410 Кб | [список файлов] |